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大豆分離蛋白的應用：

能水解大豆分離蛋白成小分子肽，大大提高了大豆分離蛋白的生物效價，使其易為人體消化吸收，同時還提高了溶解，降低了粘度，改善了大豆分離蛋白的功能特性。

 酵母抽提物、酵母浸膏的生產應用

提高最終產品的蛋白質利用率及風味

啤酒工業：

添加中性蛋白酶分解蛋白質為多肽和游離氨基氮，特別對大麥，大豆等植物性蛋白作用，用于啤酒生產，可排除蛋白質產生的"冷混濁"現象。

 醫藥工業的應用：

含中性蛋白酶的，可起到、利膽、、的。