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使用工業上應用于啤酒生產。采用北京啤酒廠生產的1398細菌蛋白酶(枯草桿菌，中性蛋白酶，酶活力40000U／g)，其用量為大麥量的0．2％左右。添加細菌蛋白酶，可使大麥汁中的蛋白質分解作用加強，有利于啤酒的風味和提高泡沫非生物穩定性等。另外，本酶可用作面團改良劑、制革、制造蛋白水解物等。用途降低面團筋力，提高面團的可塑性及延伸性，保持清晰美觀的印花圖案。特別適用于餅干生產，使餅干更容易成型和壓花，成品更松化且降低破碎率。應用1、中性蛋白酶是一種無毒、的蛋白質，可應用于動植物蛋白的水解，AN%高，水解度高，風味佳,生產高級調味品和食品營養強化劑的HAP和HVP。

多功能酶

21世紀發現有些酶分子存在多種催化活性，例如大腸桿菌DNA聚合酶I是一條分子質量為109kDa的多肽鏈，具有催化DNA鏈的合成、3’-5’核酸外切酶和5’-3’核酸外切酶的活性，用蛋白水解酶輕度水解得兩個肽段，一個含5’-3’核酸外切酶活性，另一個含另兩種酶的活性，表明大腸桿菌DNA聚合酶分子中含多個活性中心。哺乳動物的脂肪酸合成酶由兩條多肽鏈組成，每一條多肽鏈均含脂肪酸合成所需的七種酶的催化活性。這種酶分子中存在多種催化活性部位的酶稱為多功能酶（multifunctional enzyme）或串聯酶（tandem enzyme）。多功能酶在分子結構上比多酶復合體更具有優越性，因為相關的化學反應在一個酶分子上進行，比多酶復合體更有效，這也是生物進化的結果。